Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIGD6Q17RP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIGD6Q17RP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIGD6Q17RP2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIGD6Q17RP2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms