Protein–RNA interactions for Protein: Q16352

INA, Alpha-internexin, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAQ16352 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INAQ16352 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INAQ16352 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INAQ16352 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INAQ16352 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INAQ16352 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INAQ16352 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INAQ16352 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INAQ16352 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INAQ16352 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INAQ16352 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INAQ16352 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INAQ16352 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INAQ16352 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INAQ16352 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
INAQ16352 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INAQ16352 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INAQ16352 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INAQ16352 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
INAQ16352 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
INAQ16352 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INAQ16352 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INAQ16352 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INAQ16352 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INAQ16352 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INAQ16352 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INAQ16352 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INAQ16352 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INAQ16352 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INAQ16352 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INAQ16352 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INAQ16352 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INAQ16352 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INAQ16352 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INAQ16352 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INAQ16352 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
INAQ16352 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INAQ16352 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INAQ16352 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
INAQ16352 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
INAQ16352 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
INAQ16352 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
INAQ16352 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INAQ16352 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INAQ16352 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
INAQ16352 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
INAQ16352 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INAQ16352 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
INAQ16352 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
INAQ16352 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
INAQ16352 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INAQ16352 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INAQ16352 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
INAQ16352 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
INAQ16352 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
INAQ16352 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INAQ16352 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INAQ16352 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
INAQ16352 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INAQ16352 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INAQ16352 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
INAQ16352 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
INAQ16352 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms