Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD1CQ15652 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
JMJD1CQ15652 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JMJD1CQ15652 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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