Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF11Q15544 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAF11Q15544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF11Q15544 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms