Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NCAPHQ15003 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPHQ15003 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPHQ15003 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPHQ15003 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPHQ15003 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NCAPHQ15003 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPHQ15003 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPHQ15003 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPHQ15003 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPHQ15003 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCAPHQ15003 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPHQ15003 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NCAPHQ15003 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPHQ15003 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPHQ15003 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPHQ15003 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPHQ15003 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPHQ15003 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPHQ15003 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPHQ15003 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPHQ15003 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPHQ15003 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPHQ15003 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPHQ15003 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPHQ15003 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPHQ15003 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPHQ15003 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NCAPHQ15003 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCAPHQ15003 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCAPHQ15003 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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