Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM25Q14258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM25Q14258 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM25Q14258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM25Q14258 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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