Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPBGQ13641 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPBGQ13641 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPBGQ13641 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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