Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLF1Q13351 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLF1Q13351 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLF1Q13351 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLF1Q13351 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLF1Q13351 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KLF1Q13351 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms