Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLAMF1Q13291 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLAMF1Q13291 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLAMF1Q13291 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLAMF1Q13291 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLAMF1Q13291 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLAMF1Q13291 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLAMF1Q13291 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLAMF1Q13291 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms