Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
GRIN2BQ13224 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.31
GRIN2BQ13224 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
GRIN2BQ13224 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
GRIN2BQ13224 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
GRIN2BQ13224 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
GRIN2BQ13224 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2BQ13224 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
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