Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN13Q12923 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN13Q12923 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN13Q12923 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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