Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCB1Q12824 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCB1Q12824 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCB1Q12824 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMARCB1Q12824 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCB1Q12824 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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