Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLEQ07864 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLEQ07864 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLEQ07864 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLEQ07864 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLEQ07864 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLEQ07864 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLEQ07864 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLEQ07864 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLEQ07864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLEQ07864 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLEQ07864 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLEQ07864 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLEQ07864 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLEQ07864 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLEQ07864 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLEQ07864 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLEQ07864 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLEQ07864 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLEQ07864 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLEQ07864 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLEQ07864 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLEQ07864 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLEQ07864 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLEQ07864 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms