Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CXCL9Q07325 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CXCL9Q07325 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CXCL9Q07325 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CXCL9Q07325 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms