Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 UTR5YEL035C 501 nt6.58□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 STS1YIR011C 960 nt6.58□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 YMR007WYMR007W 381 nt6.58□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 DLD1YDL174C 1764 nt6.58□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 HOG1YLR113W 1308 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 THR1YHR025W 1074 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 TDH1YJL052W 999 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 SLG1YOR008C 1137 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 RCR1YBR005W 642 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 ERV2YPR037C 591 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 NMD5YJR132W 3147 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 HSM3YBR272C 1443 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 PNS1YOR161C 1620 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 YLL066CYLL066C 3618 nt6.57□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 OSM1YJR051W 1506 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 YJL213WYJL213W 996 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 ERG27YLR100W 1044 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 CCW12YLR110C 402 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 PSP2YML017W 1782 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 ADE17YMR120C 1779 nt6.56□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 SWM1YDR260C 513 nt6.55□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 PET117YER058W 324 nt6.55□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 CPT1YNL130C 1182 nt6.55□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 PRP2YNR011C 2631 nt6.55□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 MSG5YNL053W 1470 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 ASN2YGR124W 1719 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 CTF8YHR191C 402 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 SDH8YBR269C 417 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 DAL7YIR031C 1665 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 ARP3YJR065C 1350 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 YOS9YDR057W 1629 nt6.54□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 COX16YJL003W 357 nt6.53□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 YNR014WYNR014W 639 nt6.53□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 CLN1YMR199W 1641 nt6.53□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 VTS1YOR359W 1572 nt6.52□□□□□ -1.36
NEJ1Q06148 EMP65YER140W 1671 nt6.52□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 SUR7YML052W 909 nt6.52□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 YOL099CYOL099C 492 nt6.52□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 BDF2YDL070W 1917 nt6.51□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 OPI8YKR035C 642 nt6.51□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 RSP5YER125W 2430 nt6.51□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 ECM38YLR299W 1983 nt6.51□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 ERG12YMR208W 1332 nt6.5□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 SKY1YMR216C 2229 nt6.5□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 ACO1YLR304C 2337 nt6.5□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 CTA1YDR256C 1548 nt6.5□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 YEN1YER041W 2280 nt6.5□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 HSP12YFL014W 330 nt6.49□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 CIR2YOR356W 1896 nt6.49□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 TUF1YOR187W 1314 nt6.49□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 CIT2YCR005C 1383 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 HRB1YNL004W 1365 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 PPH22YDL188C 1134 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 HPT1YDR399W 666 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 HAC1YFL031W 717 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 PIL1YGR086C 1020 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 ADA2YDR448W 1305 nt6.48□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 YJR142WYJR142W 1029 nt6.47□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 PAC2YER007W 1557 nt6.47□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 YPL247CYPL247C 1572 nt6.47□□□□□ -1.37
NEJ1Q06148 GRH1YDR517W 1119 nt6.46□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 FPR2YDR519W 408 nt6.46□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 DMC1YER179W 1005 nt6.46□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YIP4YGL198W 708 nt6.46□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 DPM1YPR183W 804 nt6.46□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 SLA2YNL243W 2907 nt6.45□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 RPL5YPL131W 894 nt6.45□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 ELP4YPL101W 1371 nt6.44□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 SGE1YPR198W 1632 nt6.44□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YIA6YIL006W 1122 nt6.44□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 MLS1YNL117W 1665 nt6.44□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 RGD2YFL047W 2145 nt6.44□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YCR049CYCR049C 447 nt6.43□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 PAM17YKR065C 594 nt6.43□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 GTT3YEL017W 1014 nt6.42□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YGL081WYGL081W 963 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YJL144WYJL144W 315 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 GCN3YKR026C 918 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 ECM30YLR436C 3825 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 PEX31YGR004W 1389 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 PHO3YBR092C 1404 nt6.41□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.4□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 TAD2YJL035C 753 nt6.4□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 CUE4YML101C 354 nt6.4□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 MSI1YBR195C 1269 nt6.4□□□□□ -1.38
NEJ1Q06148 NUP53YMR153W 1428 nt6.4□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 NMA2YGR010W 1188 nt6.39□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 DYS1YHR068W 1164 nt6.39□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 GLN3YER040W 2193 nt6.39□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 HIS1YER055C 894 nt6.38□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 TRS31YDR472W 852 nt6.37□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 RIB1YBL033C 1038 nt6.37□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 RTC4YNL254C 1206 nt6.37□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 ADH5YBR145W 1056 nt6.37□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 FCY22YER060W-A 1593 nt6.36□□□□□ -1.39
NEJ1Q06148 SOD2YHR008C 702 nt6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms