RNA–Protein interactions for RNA: YBL033C

RIB1, Transcript of GTP cyclohydrolase II, yeastyeast

Gene RIB1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIB1YBL033C INO80P53115 1489 aa19.04■□□□□ 0.64
RIB1YBL033C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RIB1YBL033C DNA2P38859 1522 aa18.09■□□□□ 0.49
RIB1YBL033C SWR1Q05471 1514 aa17.83■□□□□ 0.45
RIB1YBL033C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
RIB1YBL033C KOG1P38873 1557 aa17.75■□□□□ 0.43
RIB1YBL033C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RIB1YBL033C TY1B-DR4Q07793 1604 aa17.36■□□□□ 0.37
RIB1YBL033C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RIB1YBL033C SGS1P35187 1447 aa16.81■□□□□ 0.28
RIB1YBL033C MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RIB1YBL033C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RIB1YBL033C HSL1P34244 1518 aa16.69■□□□□ 0.26
RIB1YBL033C ECM5Q03214 1411 aa16.65■□□□□ 0.26
RIB1YBL033C BUD4P47136 1447 aa16.44■□□□□ 0.22
RIB1YBL033C THO2P53552 1597 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
RIB1YBL033C MDS3P53094 1487 aa16.29■□□□□ 0.2
RIB1YBL033C HIR3P47171 1648 aa16.29■□□□□ 0.2
RIB1YBL033C REV3P14284 1504 aa16.16■□□□□ 0.18
RIB1YBL033C PEP1P32319 1579 aa16■□□□□ 0.15
RIB1YBL033C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RIB1YBL033C BPT1P14772 1559 aa15.92■□□□□ 0.14
RIB1YBL033C MIF2P35201 549 aa15.8■□□□□ 0.12
RIB1YBL033C ATG2P53855 1592 aa15.79■□□□□ 0.12
RIB1YBL033C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
RIB1YBL033C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RIB1YBL033C TAF2P23255 1407 aa15.51■□□□□ 0.07
RIB1YBL033C SSK2P53599 1579 aa15.46■□□□□ 0.07
RIB1YBL033C SIN3P22579 1536 aa15.33■□□□□ 0.04
RIB1YBL033C UFD4P33202 1483 aa15.32■□□□□ 0.04
RIB1YBL033C MET5P47169 1442 aa15.3■□□□□ 0.04
RIB1YBL033C LTE1P07866 1435 aa15.26■□□□□ 0.03
RIB1YBL033C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RIB1YBL033C YFR006WP43590 535 aa15.22■□□□□ 0.03
RIB1YBL033C SSN2P38931 1420 aa15.15■□□□□ 0.02
RIB1YBL033C CHD1P32657 1468 aa15.14■□□□□ 0.01
RIB1YBL033C CDC25P04821 1589 aa15.14■□□□□ 0.01
RIB1YBL033C ABP1P15891 592 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
RIB1YBL033C ESP1Q03018 1630 aa15.11■□□□□ 0.01
RIB1YBL033C DNF1P32660 1571 aa15.11■□□□□ 0.01
RIB1YBL033C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
RIB1YBL033C SCC2Q04002 1493 aa15.07■□□□□ 0
RIB1YBL033C BNI1P41832 1953 aa15.06■□□□□ 0
RIB1YBL033C ITT1Q04638 464 aa15.06■□□□□ 0
RIB1YBL033C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
RIB1YBL033C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RIB1YBL033C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RIB1YBL033C YPK9Q12697 1472 aa15.01□□□□□ -0.01
RIB1YBL033C RKR1Q04781 1562 aa15.01□□□□□ -0.01
RIB1YBL033C RPO31P04051 1460 aa14.97□□□□□ -0.01
RIB1YBL033C PAN1P32521 1480 aa14.95□□□□□ -0.02
RIB1YBL033C MMS1Q06211 1407 aa14.91□□□□□ -0.02
RIB1YBL033C TY1B-BRQ12193 1756 aa14.82□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY1B-GR3Q12316 1755 aa14.82□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY1B-ORQ92393 1755 aa14.82□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-FP0CX63 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-CP25384 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-DR2Q03494 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY1B-DR1Q03855 1755 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-OR1Q12113 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-DR1Q12472 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C TY2B-OR2Q12501 1770 aa14.79□□□□□ -0.04
RIB1YBL033C DRS2P39524 1355 aa14.75□□□□□ -0.05
RIB1YBL033C TRM732Q03496 1420 aa14.73□□□□□ -0.05
RIB1YBL033C DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RIB1YBL033C IRC20Q06554 1556 aa14.68□□□□□ -0.06
RIB1YBL033C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RIB1YBL033C MMS22Q06164 1454 aa14.68□□□□□ -0.06
RIB1YBL033C VPS15P22219 1454 aa14.61□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-HO13535 1793 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-JR1P47098 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-ER1Q03612 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-GR2Q12269 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-OLQ12273 1755 aa14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RIB1YBL033C NUP159P40477 1460 aa14.58□□□□□ -0.08
RIB1YBL033C TY2B-BQ12491 1770 aa14.58□□□□□ -0.08
RIB1YBL033C YRF1-1P0CX20 1796 aa14.53□□□□□ -0.08
RIB1YBL033C YRF1-5P0CX21 1796 aa14.53□□□□□ -0.08
RIB1YBL033C YRF1-8P0CX22 1796 aa14.53□□□□□ -0.08
RIB1YBL033C TY1B-DR3Q99231 1755 aa14.49□□□□□ -0.09
RIB1YBL033C DNF2Q12675 1612 aa14.48□□□□□ -0.09
RIB1YBL033C SPP41P38904 1435 aa14.42□□□□□ -0.1
RIB1YBL033C SMC4Q12267 1418 aa14.35□□□□□ -0.11
RIB1YBL033C NTE1Q04958 1679 aa14.34□□□□□ -0.11
RIB1YBL033C TSC11P40061 1430 aa14.33□□□□□ -0.11
RIB1YBL033C POL1P13382 1468 aa14.31□□□□□ -0.12
RIB1YBL033C NUP170P38181 1502 aa14.3□□□□□ -0.12
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