Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB3Q05901 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB3Q05901 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB3Q05901 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB3Q05901 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms