Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAV1Q03135 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV1Q03135 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV1Q03135 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms