Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NHLH2Q02577 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NHLH2Q02577 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NHLH2Q02577 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms