Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF17Q02223 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF17Q02223 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF17Q02223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms