Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FLI1Q01543 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FLI1Q01543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FLI1Q01543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FLI1Q01543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FLI1Q01543 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FLI1Q01543 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FLI1Q01543 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FLI1Q01543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms