Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A2Q01362 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A2Q01362 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A2Q01362 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A2Q01362 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms