Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSG6Q00889 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSG6Q00889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSG6Q00889 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSG6Q00889 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms