Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMAD3P84022 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMAD3P84022 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMAD3P84022 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMAD3P84022 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms