Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX1P83916 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX1P83916 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX1P83916 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBX1P83916 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX1P83916 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX1P83916 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX1P83916 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CBX1P83916 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX1P83916 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX1P83916 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX1P83916 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CBX1P83916 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX1P83916 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX1P83916 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CBX1P83916 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX1P83916 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX1P83916 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX1P83916 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CBX1P83916 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CBX1P83916 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX1P83916 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX1P83916 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CBX1P83916 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX1P83916 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX1P83916 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX1P83916 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX1P83916 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CBX1P83916 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX1P83916 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX1P83916 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX1P83916 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX1P83916 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CBX1P83916 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CBX1P83916 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX1P83916 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CBX1P83916 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX1P83916 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX1P83916 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX1P83916 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX1P83916 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CBX1P83916 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX1P83916 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX1P83916 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX1P83916 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CBX1P83916 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX1P83916 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX1P83916 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX1P83916 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX1P83916 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CBX1P83916 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX1P83916 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX1P83916 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX1P83916 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX1P83916 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX1P83916 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX1P83916 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX1P83916 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX1P83916 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX1P83916 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX1P83916 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX1P83916 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX1P83916 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX1P83916 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX1P83916 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX1P83916 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX1P83916 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX1P83916 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX1P83916 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX1P83916 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX1P83916 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX1P83916 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX1P83916 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX1P83916 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX1P83916 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX1P83916 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX1P83916 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX1P83916 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX1P83916 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms