Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPS25P82663 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPS25P82663 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPS25P82663 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms