Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCR4P61073 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXCR4P61073 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR4P61073 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms