Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PER3P56645 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PER3P56645 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PER3P56645 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PER3P56645 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PER3P56645 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PER3P56645 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PER3P56645 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PER3P56645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PER3P56645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PER3P56645 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PER3P56645 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PER3P56645 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PER3P56645 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PER3P56645 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PER3P56645 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PER3P56645 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PER3P56645 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PER3P56645 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PER3P56645 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PER3P56645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PER3P56645 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PER3P56645 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PER3P56645 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PER3P56645 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PER3P56645 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PER3P56645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PER3P56645 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PER3P56645 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PER3P56645 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PER3P56645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms