Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME5P56597 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME5P56597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NME5P56597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NME5P56597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME5P56597 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME5P56597 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME5P56597 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME5P56597 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME5P56597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME5P56597 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME5P56597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NME5P56597 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME5P56597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME5P56597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME5P56597 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME5P56597 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME5P56597 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME5P56597 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME5P56597 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME5P56597 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME5P56597 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME5P56597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NME5P56597 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME5P56597 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NME5P56597 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME5P56597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME5P56597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NME5P56597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME5P56597 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME5P56597 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NME5P56597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NME5P56597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NME5P56597 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME5P56597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME5P56597 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME5P56597 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NME5P56597 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NME5P56597 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME5P56597 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME5P56597 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NME5P56597 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME5P56597 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME5P56597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME5P56597 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME5P56597 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NME5P56597 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME5P56597 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME5P56597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME5P56597 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NME5P56597 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME5P56597 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME5P56597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME5P56597 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME5P56597 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME5P56597 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME5P56597 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME5P56597 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME5P56597 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME5P56597 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME5P56597 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME5P56597 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NME5P56597 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME5P56597 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME5P56597 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.7 ms