Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFV3P56181 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFV3P56181 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.8 ms