Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52P55327 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52P55327 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52P55327 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52P55327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52P55327 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52P55327 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPD52P55327 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52P55327 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52P55327 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52P55327 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52P55327 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52P55327 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52P55327 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52P55327 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52P55327 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52P55327 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52P55327 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52P55327 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52P55327 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52P55327 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52P55327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52P55327 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52P55327 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52P55327 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52P55327 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52P55327 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52P55327 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52P55327 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPD52P55327 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52P55327 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52P55327 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52P55327 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52P55327 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPD52P55327 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPD52P55327 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPD52P55327 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPD52P55327 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPD52P55327 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms