Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HADHBP55084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HADHBP55084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HADHBP55084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HADHBP55084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HADHBP55084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HADHBP55084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HADHBP55084 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HADHBP55084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HADHBP55084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HADHBP55084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HADHBP55084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HADHBP55084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HADHBP55084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HADHBP55084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HADHBP55084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HADHBP55084 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HADHBP55084 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HADHBP55084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HADHBP55084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HADHBP55084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HADHBP55084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HADHBP55084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HADHBP55084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HADHBP55084 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HADHBP55084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HADHBP55084 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HADHBP55084 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HADHBP55084 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HADHBP55084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HADHBP55084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HADHBP55084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HADHBP55084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HADHBP55084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HADHBP55084 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HADHBP55084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HADHBP55084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HADHBP55084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HADHBP55084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HADHBP55084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HADHBP55084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HADHBP55084 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HADHBP55084 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HADHBP55084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HADHBP55084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HADHBP55084 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HADHBP55084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HADHBP55084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HADHBP55084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HADHBP55084 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HADHBP55084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HADHBP55084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HADHBP55084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HADHBP55084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HADHBP55084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HADHBP55084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HADHBP55084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HADHBP55084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HADHBP55084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HADHBP55084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HADHBP55084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HADHBP55084 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HADHBP55084 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HADHBP55084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HADHBP55084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HADHBP55084 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HADHBP55084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HADHBP55084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HADHBP55084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HADHBP55084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HADHBP55084 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms