Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGGTBP53611 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGGTBP53611 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABGGTBP53611 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABGGTBP53611 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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