Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUBP1P53384 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUBP1P53384 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUBP1P53384 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUBP1P53384 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms