Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGA2P52926 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGA2P52926 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms