Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HK3P52790 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HK3P52790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HK3P52790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HK3P52790 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HK3P52790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HK3P52790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HK3P52790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HK3P52790 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HK3P52790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HK3P52790 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HK3P52790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HK3P52790 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HK3P52790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HK3P52790 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HK3P52790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HK3P52790 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HK3P52790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HK3P52790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HK3P52790 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HK3P52790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HK3P52790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HK3P52790 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HK3P52790 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HK3P52790 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HK3P52790 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HK3P52790 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HK3P52790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HK3P52790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HK3P52790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HK3P52790 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HK3P52790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HK3P52790 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HK3P52790 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HK3P52790 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HK3P52790 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HK3P52790 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HK3P52790 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HK3P52790 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HK3P52790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HK3P52790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HK3P52790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HK3P52790 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HK3P52790 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HK3P52790 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HK3P52790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HK3P52790 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HK3P52790 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HK3P52790 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HK3P52790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HK3P52790 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HK3P52790 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HK3P52790 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HK3P52790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HK3P52790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HK3P52790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HK3P52790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HK3P52790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HK3P52790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HK3P52790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HK3P52790 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HK3P52790 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HK3P52790 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HK3P52790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HK3P52790 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HK3P52790 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HK3P52790 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HK3P52790 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HK3P52790 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms