Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VASPP50552 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VASPP50552 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VASPP50552 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASPP50552 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASPP50552 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASPP50552 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VASPP50552 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASPP50552 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASPP50552 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASPP50552 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASPP50552 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VASPP50552 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASPP50552 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASPP50552 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASPP50552 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASPP50552 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VASPP50552 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASPP50552 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASPP50552 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASPP50552 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASPP50552 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VASPP50552 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VASPP50552 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VASPP50552 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VASPP50552 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VASPP50552 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VASPP50552 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VASPP50552 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VASPP50552 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VASPP50552 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VASPP50552 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VASPP50552 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VASPP50552 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VASPP50552 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VASPP50552 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VASPP50552 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VASPP50552 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VASPP50552 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VASPP50552 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VASPP50552 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VASPP50552 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VASPP50552 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VASPP50552 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VASPP50552 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VASPP50552 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VASPP50552 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VASPP50552 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VASPP50552 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VASPP50552 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VASPP50552 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VASPP50552 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VASPP50552 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VASPP50552 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VASPP50552 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VASPP50552 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VASPP50552 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VASPP50552 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VASPP50552 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VASPP50552 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VASPP50552 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VASPP50552 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VASPP50552 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VASPP50552 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VASPP50552 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VASPP50552 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VASPP50552 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VASPP50552 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VASPP50552 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VASPP50552 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VASPP50552 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VASPP50552 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VASPP50552 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VASPP50552 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VASPP50552 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VASPP50552 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms