Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ETV1P50549 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV1P50549 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV1P50549 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ETV1P50549 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ETV1P50549 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ETV1P50549 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV1P50549 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV1P50549 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV1P50549 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETV1P50549 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV1P50549 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV1P50549 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV1P50549 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV1P50549 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETV1P50549 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETV1P50549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV1P50549 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV1P50549 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETV1P50549 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV1P50549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETV1P50549 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETV1P50549 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV1P50549 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV1P50549 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETV1P50549 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV1P50549 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ETV1P50549 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETV1P50549 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETV1P50549 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV1P50549 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV1P50549 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV1P50549 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV1P50549 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ETV1P50549 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV1P50549 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV1P50549 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ETV1P50549 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV1P50549 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV1P50549 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV1P50549 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV1P50549 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ETV1P50549 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV1P50549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV1P50549 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV1P50549 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ETV1P50549 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV1P50549 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ETV1P50549 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms