Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMB3P49720 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMB3P49720 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB3P49720 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB3P49720 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms