Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP2P46087 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NOP2P46087 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NOP2P46087 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NOP2P46087 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP2P46087 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP2P46087 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP2P46087 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NOP2P46087 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NOP2P46087 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NOP2P46087 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NOP2P46087 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP2P46087 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NOP2P46087 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP2P46087 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP2P46087 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NOP2P46087 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NOP2P46087 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP2P46087 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP2P46087 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NOP2P46087 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP2P46087 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP2P46087 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP2P46087 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP2P46087 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NOP2P46087 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP2P46087 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP2P46087 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP2P46087 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NOP2P46087 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP2P46087 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP2P46087 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP2P46087 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP2P46087 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NOP2P46087 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP2P46087 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NOP2P46087 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP2P46087 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP2P46087 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP2P46087 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP2P46087 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NOP2P46087 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP2P46087 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOP2P46087 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NOP2P46087 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP2P46087 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP2P46087 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP2P46087 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOP2P46087 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOP2P46087 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP2P46087 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOP2P46087 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP2P46087 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOP2P46087 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOP2P46087 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOP2P46087 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP2P46087 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP2P46087 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOP2P46087 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NOP2P46087 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP2P46087 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOP2P46087 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms