Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR2P43308 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR2P43308 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR2P43308 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR2P43308 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR2P43308 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR2P43308 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR2P43308 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR2P43308 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR2P43308 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR2P43308 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSR2P43308 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR2P43308 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSR2P43308 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR2P43308 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR2P43308 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSR2P43308 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSR2P43308 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR2P43308 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR2P43308 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSR2P43308 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSR2P43308 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR2P43308 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR2P43308 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR2P43308 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR2P43308 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSR2P43308 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SSR2P43308 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SSR2P43308 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SSR2P43308 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SSR2P43308 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR2P43308 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR2P43308 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSR2P43308 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSR2P43308 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSR2P43308 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SSR2P43308 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR2P43308 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR2P43308 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR2P43308 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSR2P43308 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSR2P43308 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSR2P43308 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSR2P43308 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR2P43308 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSR2P43308 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 765.9 ms