Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRP43088 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGFRP43088 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGFRP43088 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRP43088 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRP43088 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRP43088 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRP43088 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRP43088 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRP43088 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRP43088 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRP43088 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRP43088 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRP43088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRP43088 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRP43088 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRP43088 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRP43088 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRP43088 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRP43088 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms