Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMELP40967 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMELP40967 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMELP40967 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PMELP40967 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMELP40967 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMELP40967 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMELP40967 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMELP40967 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMELP40967 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMELP40967 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PMELP40967 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMELP40967 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMELP40967 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMELP40967 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMELP40967 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMELP40967 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMELP40967 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMELP40967 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMELP40967 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PMELP40967 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMELP40967 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMELP40967 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PMELP40967 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMELP40967 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMELP40967 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMELP40967 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMELP40967 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMELP40967 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMELP40967 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PMELP40967 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMELP40967 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMELP40967 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMELP40967 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMELP40967 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMELP40967 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMELP40967 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMELP40967 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMELP40967 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMELP40967 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PMELP40967 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PMELP40967 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PMELP40967 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMELP40967 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMELP40967 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMELP40967 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMELP40967 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PMELP40967 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMELP40967 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMELP40967 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMELP40967 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMELP40967 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMELP40967 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMELP40967 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMELP40967 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMELP40967 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms