Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS4P35443 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS4P35443 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
THBS4P35443 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
THBS4P35443 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
THBS4P35443 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
THBS4P35443 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
THBS4P35443 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
THBS4P35443 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
THBS4P35443 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS4P35443 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS4P35443 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
THBS4P35443 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
THBS4P35443 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THBS4P35443 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THBS4P35443 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THBS4P35443 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
THBS4P35443 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THBS4P35443 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS4P35443 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS4P35443 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS4P35443 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS4P35443 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS4P35443 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS4P35443 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS4P35443 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS4P35443 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS4P35443 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS4P35443 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS4P35443 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS4P35443 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS4P35443 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS4P35443 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS4P35443 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS4P35443 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS4P35443 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS4P35443 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS4P35443 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS4P35443 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms