Protein–RNA interactions for Protein: P30305

CDC25B, M-phase inducer phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25BP30305 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC25BP30305 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC25BP30305 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC25BP30305 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC25BP30305 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC25BP30305 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC25BP30305 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC25BP30305 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC25BP30305 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms