Protein–RNA interactions for Protein: P30050

RPL12, 60S ribosomal protein L12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL12P30050 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL12P30050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL12P30050 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL12P30050 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL12P30050 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL12P30050 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL12P30050 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL12P30050 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPL12P30050 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL12P30050 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL12P30050 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL12P30050 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPL12P30050 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL12P30050 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL12P30050 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL12P30050 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL12P30050 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL12P30050 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL12P30050 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL12P30050 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL12P30050 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL12P30050 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL12P30050 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL12P30050 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL12P30050 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL12P30050 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL12P30050 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL12P30050 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL12P30050 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL12P30050 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL12P30050 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL12P30050 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL12P30050 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL12P30050 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL12P30050 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL12P30050 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL12P30050 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL12P30050 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL12P30050 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms