Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR4A1P22736 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR4A1P22736 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR4A1P22736 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR4A1P22736 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms