Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1B2P21281 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V1B2P21281 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6V1B2P21281 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6V1B2P21281 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms