Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD247P20963 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD247P20963 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD247P20963 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD247P20963 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD247P20963 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD247P20963 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD247P20963 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD247P20963 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD247P20963 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD247P20963 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD247P20963 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD247P20963 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD247P20963 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD247P20963 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CD247P20963 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD247P20963 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD247P20963 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD247P20963 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD247P20963 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD247P20963 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD247P20963 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD247P20963 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD247P20963 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD247P20963 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD247P20963 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD247P20963 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD247P20963 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD247P20963 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD247P20963 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD247P20963 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD247P20963 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD247P20963 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD247P20963 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD247P20963 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD247P20963 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD247P20963 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD247P20963 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD247P20963 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD247P20963 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD247P20963 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD247P20963 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD247P20963 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD247P20963 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD247P20963 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD247P20963 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD247P20963 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD247P20963 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD247P20963 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms