Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XRCC1P18887 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XRCC1P18887 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XRCC1P18887 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XRCC1P18887 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms